1、定义上的区别： 1、旗舰店：商家以自己的品牌进入淘宝商城，其开设的店铺称为该品牌的“官方旗舰店”。
2、专卖店：企业持有正式的品牌授权书，在淘宝商城开设该品牌的专卖店，称为“品牌专卖店”。
3、专营店：企业在淘宝商城同一品类下经营多个（至少两个）品牌。
这样的商店被称为“专卖店”。
二、经营主体差异： 1、旗舰店：自有品牌企业（品牌必须为申请开店的企业或企业法定代表人拥有）。
2、专卖店：经品牌方或公司正式授权的企业法人。
3、专卖店：在中国大陆注册的企业法人。
三、经营范围差异： 1、旗舰店：同一品牌、同一一级品类的所有产品。
2、专卖店：授权品牌下的所有同品类产品。
3、专卖店没有明确的规定。
京东自营店及旗舰店入驻费 京东自营店：采用押金+产品毛额保证。
产品毛保的具体价值需要与京东官方自营代购沟通。
大概会在20-30%左右，需要商家提供供货价格和销售价格。
1、旗舰店 京东旗舰店是指品牌企业或销售商户在京东平台设立、经营的专卖店。
与其他类型的商店相比，旗舰店拥有更高的官方认证和高品质的产品保证。
这也是很多大品牌选择在京东开设旗舰店的原因。
在旗舰店，您可以找到品牌最全面的产品信息、最新款式的产品以及专业的售后服务。
2、专卖店 京东专卖店是指某品牌或销售商户在京东平台上独家经营的店铺。
专卖店的货源全部来自官方供应商，价格比其他类型的商店更优惠。
一些小众品牌往往会选择在京东开设专卖店，因为这样可以获得更好的品牌认知度和销量。
3、POP店POP店是指个人卖家或小企业在京东平台开设的店铺。
与旗舰店、专卖店相比，POP店的商品种类更加丰富，价格也相对便宜。
如果你想选择性价比更高的产品，可以去京东的POP店。
4、PLUS会员店 PLUS会员店是指加入京东PLUS服务并符合一定资质要求的商户开设的商店。
PLUS会员店信誉更高，服务更好。
如果您是JD PLUS会员，在PLUS会员店购买商品时可以享受更多折扣和福利。
5、自营店 京东自营店是指京东自营的网上商店。
在自营店购物时，您可以享受京东提供的最优惠的产品价格、质量保证和快捷的配送服务。
自营店也是京东的核心竞争力之一。