MongoDB是一种非关系型数据库，它以文档的形式存储数据。MongoDB的一个特点是它会尽可能地使用内存来提高查询效率，同时也会将数据持久化到磁盘上。那么，MongoDB是如何在内存和磁盘之间分配和管理数据的呢？
首先，我们要了解MongoDB的数据结构。MongoDB将数据分为两个层次：数据库（database）和集合（collection）。数据库是一组相关的集合，集合是一组相关的文档。文档是一种键值对的数据格式，类似于JSON。每个文档都有一个唯一的标识符，称为ObjectId。
MongoDB将每个数据库的数据文件存储在一个单独的目录下，目录名为数据库名。每个数据库目录下有两种类型的文件：数据文件（.ns和.0, .1, .2等）和日志文件（.wt或.wiredtiger）。数据文件包含了数据库中所有集合和索引的元数据和实际数据，日志文件包含了数据库中所有操作的记录，用于恢复和备份。
MongoDB使用了一种称为WiredTiger的存储引擎，它可以在内存和磁盘之间高效地压缩和传输数据。WiredTiger使用了一种称为B树（B-tree）的数据结构来组织数据文件中的数据。B树是一种平衡的多路搜索树，它可以快速地查找、插入和删除数据。B树由一个根节点、若干个内部节点和若干个叶子节点组成。每个节点可以包含多个键值对，每个键值对指向一个文档或者一个子节点。叶子节点包含了实际的文档数据，内部节点包含了索引信息。
WiredTiger将B树中的每个节点作为一个单元，称为页面（page）。页面有两种类型：内存页面（in-memory page）和磁盘页面（on-disk page）。内存页面是B树中当前活跃的节点，它们被加载到内存中，用于响应查询请求。磁盘页面是B树中不活跃或者已经修改过的节点，它们被写入到磁盘中，用于持久化数据。
WiredTiger使用了一种称为检查点（checkpoint）的机制来同步内存页面和磁盘页面。检查点是一个特定的时间点，当检查点发生时，WiredTiger会将内存中所有修改过的页面写入到磁盘中，并更新元数据文件。检查点可以由用户手动触发，也可以由系统自动触发。系统会根据以下条件来决定是否触发检查点：
1.每隔60秒
2.当磁盘空间不足时
3.当日志文件达到2GB时
4.当关闭数据库时
通过检查点机制，WiredTiger可以保证在发生故障或者关闭数据库时，不会丢失任何已经提交的操作。
除了检查点机制外，WiredTiger还使用了一种称为日志（journal）的机制来保证数据的完整性。日志是一种顺序的操作记录，它记录了每个事务对数据库的修改。日志文件存储在数据库目录下的journal子目录中，每个日志文件的大小为100MB。