HBase和MySQL是两种常用的数据库系统，但它们有很多不同之处。本文将从数据模型、存储结构和应用场景三个方面来对比它们的异同，并给出一些选择建议。
数据模型
HBase是一个分布式的列式数据库，它基于Google的Bigtable设计，属于NoSQL（非关系型）数据库的一种。HBase的数据模型是一个多维的稀疏表，每个表由行键、列族和时间戳组成。每个列族可以包含任意数量的列，每个列可以有多个版本，每个版本由时间戳标识。HBase没有固定的表结构，可以动态地添加或删除列，也可以存储不同类型的数据。
MySQL是一个关系型数据库，它遵循SQL（结构化查询语言）标准，支持ACID（原子性、一致性、隔离性、持久性）事务。MySQL的数据模型是一个二维的表格，每个表由行和列组成。每个表有一个固定的表结构，需要预先定义好每个列的名称、类型和约束。MySQL只能存储结构化或半结构化的数据。
存储结构
HBase是一个分布式文件系统（HDFS）上的数据库，它将数据分片存储在多个节点上，每个节点负责一部分数据。HBase使用LSM（日志结构合并）树作为底层的存储结构，它将写入操作先缓存在内存中，然后批量地写入磁盘上的有序文件。HBase通过压缩、合并和分裂等操作来优化文件的大小和读写性能。
MySQL是一个单机数据库，它将数据存储在一个或多个文件中，每个文件对应一个表或一个索引。MySQL使用B+树作为底层的存储结构，它将数据按照键值排序存储在磁盘上的页中。MySQL通过索引、分区和复制等操作来提高查询效率和可靠性。
应用场景
HBase适合处理海量的非结构化或半结构化数据，例如日志、文档、图片等。HBase支持高并发的写入操作，以及按照行键或列族进行范围查询或单点查询的读取操作。HBase不支持复杂的SQL查询，也不支持事务和连接等功能。HBase常用于大数据分析、搜索引擎、推荐系统等场景。
MySQL适合处理规模较小的结构化或半结构化数据，例如用户信息、订单记录、商品库存等。MySQL支持丰富的SQL查询，以及事务和连接等功能。MySQL不支持高并发的写入操作，也不支持按照任意条件进行范围查询或聚合查询的读取操作。MySQL常用于网站开发、电子商务、金融系统等场景。
HBase和MySQL是两种不同类型的数据库系统，它们各有各的优势和局限。在选择数据库时，需要根据数据量、数据类型、业务需求和成本等因素来综合考虑。一般来说，如果需要处理大规模的非结构化数据，或者需要高效的写入性能，可以选择HBase；如果需要处理小规模的结构化数据，或者需要复杂的查询功能，可以选择MySQL。